MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC2

Total Repeats: 1838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017076	A	6	6	78	83	100 %	0 %	0 %	0 %	383760554
2	NC_017076	CAA	2	6	198	203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760554
3	NC_017076	CAG	2	6	230	235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760554
4	NC_017076	CCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760554
5	NC_017076	A	7	7	267	273	100 %	0 %	0 %	0 %	383760554
6	NC_017076	TC	3	6	306	311	0 %	50 %	0 %	50 %	383760554
7	NC_017076	ATTG	2	8	363	370	25 %	50 %	25 %	0 %	383760554
8	NC_017076	CAT	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
9	NC_017076	ATC	3	9	448	456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
10	NC_017076	CAGCT	2	10	487	496	20 %	20 %	20 %	40 %	383760554
11	NC_017076	CAT	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
12	NC_017076	CAT	2	6	531	536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
13	NC_017076	TA	3	6	568	573	50 %	50 %	0 %	0 %	383760554
14	NC_017076	GCCCG	2	10	583	592	0 %	0 %	40 %	60 %	383760554
15	NC_017076	AAT	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760554
16	NC_017076	GCA	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760554
17	NC_017076	GCT	2	6	735	740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760554
18	NC_017076	TTC	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760554
19	NC_017076	TGA	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760554
20	NC_017076	GGT	2	6	948	953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760554
21	NC_017076	CAG	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760555
22	NC_017076	GAA	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760555
23	NC_017076	TGA	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
24	NC_017076	A	7	7	1253	1259	100 %	0 %	0 %	0 %	383760555
25	NC_017076	TAC	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760555
26	NC_017076	ATG	2	6	1401	1406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
27	NC_017076	AG	3	6	1500	1505	50 %	0 %	50 %	0 %	383760555
28	NC_017076	GA	3	6	1570	1575	50 %	0 %	50 %	0 %	383760555
29	NC_017076	CAT	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760555
30	NC_017076	TCT	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
31	NC_017076	TTC	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
32	NC_017076	ATG	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
33	NC_017076	GTC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760555
34	NC_017076	CTTC	2	8	1722	1729	0 %	50 %	0 %	50 %	383760555
35	NC_017076	CTT	2	6	1769	1774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
36	NC_017076	TGCTCC	2	12	1861	1872	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383760555
37	NC_017076	CT	3	6	1879	1884	0 %	50 %	0 %	50 %	383760555
38	NC_017076	AAAC	2	8	1978	1985	75 %	0 %	0 %	25 %	383760555
39	NC_017076	GAA	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760555
40	NC_017076	T	6	6	2076	2081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017076	ACA	2	6	2103	2108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017076	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017076	CAA	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017076	TTC	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017076	TTTC	2	8	2229	2236	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017076	CAT	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017076	CCA	2	6	2551	2556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017076	TA	3	6	2586	2591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017076	T	6	6	2597	2602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017076	AT	3	6	2608	2613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017076	TTG	2	6	2645	2650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017076	TAA	2	6	2687	2692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017076	AC	3	6	2731	2736	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
54	NC_017076	TCTT	2	8	2750	2757	0 %	75 %	0 %	25 %	383760556
55	NC_017076	AG	3	6	2790	2795	50 %	0 %	50 %	0 %	383760556
56	NC_017076	CA	3	6	2826	2831	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
57	NC_017076	TTG	2	6	2852	2857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760556
58	NC_017076	ACG	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760556
59	NC_017076	AAAAG	2	10	2941	2950	80 %	0 %	20 %	0 %	383760556
60	NC_017076	GTG	2	6	3029	3034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760556
61	NC_017076	TCC	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760556
62	NC_017076	GAT	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
63	NC_017076	TATT	2	8	3130	3137	25 %	75 %	0 %	0 %	383760556
64	NC_017076	AGGA	2	8	3146	3153	50 %	0 %	50 %	0 %	383760556
65	NC_017076	CATCTA	2	12	3213	3224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760556
66	NC_017076	TCT	2	6	3298	3303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760556
67	NC_017076	CTG	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760556
68	NC_017076	AC	3	6	3369	3374	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
69	NC_017076	CTT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760556
70	NC_017076	CCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760556
71	NC_017076	AAG	2	6	3511	3516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760556
72	NC_017076	A	6	6	3586	3591	100 %	0 %	0 %	0 %	383760556
73	NC_017076	GAT	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
74	NC_017076	CAT	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760556
75	NC_017076	ATGTA	2	10	3635	3644	40 %	40 %	20 %	0 %	383760556
76	NC_017076	A	6	6	3667	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	383760556
77	NC_017076	TGA	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
78	NC_017076	AGCTCA	2	12	3816	3827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383760556
79	NC_017076	TTA	2	6	3858	3863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760556
80	NC_017076	AGC	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760556
81	NC_017076	A	6	6	3967	3972	100 %	0 %	0 %	0 %	383760556
82	NC_017076	GCAT	2	8	3987	3994	25 %	25 %	25 %	25 %	383760556
83	NC_017076	AAG	2	6	4003	4008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760556
84	NC_017076	ATT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760556
85	NC_017076	GAA	2	6	4119	4124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017076	TAA	2	6	4174	4179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017076	AATAT	2	10	4180	4189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017076	TAT	2	6	4202	4207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760557
89	NC_017076	ACG	2	6	4219	4224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760557
90	NC_017076	GAA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
91	NC_017076	AAG	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
92	NC_017076	CAT	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760557
93	NC_017076	GAA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
94	NC_017076	GAAT	2	8	4373	4380	50 %	25 %	25 %	0 %	383760557
95	NC_017076	GAAA	2	8	4391	4398	75 %	0 %	25 %	0 %	383760557
96	NC_017076	GAA	2	6	4422	4427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
97	NC_017076	A	7	7	4451	4457	100 %	0 %	0 %	0 %	383760557
98	NC_017076	CAT	3	9	4514	4522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017076	GTT	2	6	4540	4545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760558
100	NC_017076	CTA	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760558
101	NC_017076	CAC	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760558
102	NC_017076	GCA	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760558
103	NC_017076	TCA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760558
104	NC_017076	GAAG	2	8	4782	4789	50 %	0 %	50 %	0 %	383760558
105	NC_017076	ACC	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760558
106	NC_017076	AAG	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760558
107	NC_017076	GGCT	2	8	5149	5156	0 %	25 %	50 %	25 %	383760558
108	NC_017076	GAAT	2	8	5203	5210	50 %	25 %	25 %	0 %	383760558
109	NC_017076	CAGGA	2	10	5335	5344	40 %	0 %	40 %	20 %	383760558
110	NC_017076	ATT	2	6	5352	5357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760558
111	NC_017076	GAAAA	2	10	5430	5439	80 %	0 %	20 %	0 %	383760559
112	NC_017076	A	6	6	5436	5441	100 %	0 %	0 %	0 %	383760559
113	NC_017076	CAG	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760559
114	NC_017076	TCA	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760560
115	NC_017076	GCC	2	6	5724	5729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
116	NC_017076	CGC	2	6	5767	5772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
117	NC_017076	AGG	3	9	5773	5781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760560
118	NC_017076	CTG	2	6	5849	5854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
119	NC_017076	TGA	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760560
120	NC_017076	TGG	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760560
121	NC_017076	GCA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760560
122	NC_017076	CTAT	2	8	5973	5980	25 %	50 %	0 %	25 %	383760560
123	NC_017076	ATTC	2	8	5995	6002	25 %	50 %	0 %	25 %	383760560
124	NC_017076	ATA	2	6	6098	6103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760560
125	NC_017076	ATT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760560
126	NC_017076	T	6	6	6198	6203	0 %	100 %	0 %	0 %	383760560
127	NC_017076	CAC	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760560
128	NC_017076	TCC	2	6	6339	6344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760560
129	NC_017076	CTG	2	6	6364	6369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
130	NC_017076	CAC	2	6	6391	6396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760560
131	NC_017076	CT	3	6	6425	6430	0 %	50 %	0 %	50 %	383760560
132	NC_017076	GCC	2	6	6467	6472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
133	NC_017076	GCT	2	6	6473	6478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
134	NC_017076	AAAGC	2	10	6509	6518	60 %	0 %	20 %	20 %	383760560
135	NC_017076	ATC	2	6	6639	6644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017076	CAG	3	9	6656	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017076	CTT	2	6	6683	6688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017076	TGC	3	9	6738	6746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017076	CTT	2	6	6755	6760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017076	CA	3	6	6814	6819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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248	NC_017076	CAAA	2	8	12529	12536	75 %	0 %	0 %	25 %	383760566
249	NC_017076	CAG	2	6	12625	12630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_017076	CAT	2	6	12661	12666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760567
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253	NC_017076	GGAAAT	2	12	13135	13146	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383760568
254	NC_017076	CCA	2	6	13195	13200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760568
255	NC_017076	CCA	2	6	13255	13260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760568
256	NC_017076	GGA	2	6	13307	13312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760568
257	NC_017076	TGC	2	6	13356	13361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760568
258	NC_017076	CAT	2	6	13369	13374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760568
259	NC_017076	AAG	2	6	13440	13445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760568
260	NC_017076	GAT	2	6	13463	13468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760568
261	NC_017076	ATC	2	6	13536	13541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760568
262	NC_017076	GCC	2	6	13613	13618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760568
263	NC_017076	AGC	2	6	13682	13687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760568
264	NC_017076	ATTTC	2	10	13771	13780	20 %	60 %	0 %	20 %	383760568
265	NC_017076	TC	3	6	13779	13784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
266	NC_017076	CTC	2	6	13788	13793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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